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Registros recuperados: 14 | |
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Arnaud, Sophie; Goyard, Emmanuel; Prou, Jean; Vonau, Vincent; Bonhomme, Francois; Boudry, Pierre. |
Exploitation of the pearl oyster Pinetada margaritifera, which has developed in French Polynesia over the last twenty years, is based mainly on the collection of natural spat. Recruitment is highly variable in space and time and so spat is very often transferred by the farmers between atolls or even between archipelagos. In previous studies, anonymous nuclear markers demonstrated that This development has coincided with a genetic homogenisation of the wild stocks since the 1980s. This suggests a high level of reproductive success on farms, which is likely to be due to the high density of animaIs when compared to the density in the wild. We used the same markers to show that the level of genetic variability observed on farms is not significantly different... |
Tipo: Text |
Palavras-chave: French Polynesia; Genetic diversity; Spat; Pinctada margaritifera; Pearl oyster; Polynésie française; Diversité génétique; Naissain; Pinctada margaritifera; Huître perlière. |
Ano: 2005 |
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/2005/publication-3822.PDF |
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Boudry, Pierre; Launey, Sophie; Diaz-almela, A.; Naciri-graven, Yamama; Ledu, Christophe; Mira, S.; Taris, Nicolas; Bonhomme, Francois; Lapegue, Sylvie. |
PCR-based DNA markers enable the study of diversity and differentiation of marine organisms at different stages of their life cycle. Our study of European fiat oyster (Ostrea edulis) populations aimed to describe their spatial and temporal dynamics. First, we analyzed adults sampled over the natural range of the species. An Atlantic/Mediterranean differentiation pattern was observed. Similar patterns of variation were found using allozymes, microsatellites and mitochondrial DNA, aIl which support an isolation by distance model. High variability was observed in the range of diversity between populations using a mitochondrial marker, a reflection of small effective population sizes in sorne locations. A 10fold quantitative difference was observed in Fst,... |
Tipo: Text |
Palavras-chave: Recruitment; Diversity; Molecular markers; Population genetics; Ostrea edulis; Flat oyster; Dynamique de recrutement; Diversité génétique; Microsatellites; Marqueurs moléculaires; Génétique des populations; Ostrea edulis; Huître plate. |
Ano: 2003 |
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/2003/acte-2851.pdf |
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Da Silva, Sara Maria Mira. |
Les études de génétique des populations des bivalves marins ont fréquemment mit en évidence une relation hétérozygotie / valeur sélective, et un fort déficit en hétérozygotes. Parmi les hypothèses explicatives de ces deux phénomènes, la création d'individus consanguins dans les populations est particulièrement intéressante à tester. Le but de ce travail était de vérifier s'il pouvait y avoir un nombre faible de géniteurs à la base d'un événement de reproduction donné chez l'huître plate Ostrea edulis. Dans cette étude, nous montrons qu'une cohorte de captage collectée sur un intervalle de temps très court (15 jours), présente une diversité génétique fortement réduite ainsi qu'une modification des fréquences alléliques par rapport aux populations d'adultes... |
Tipo: Text |
Palavras-chave: Génétique population; Huître plate; Ostrea edulis; Diversité génétique; Variabilité génétique. |
Ano: 2001 |
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Diaz Almela, Elena. |
La structuration géographique des populations naturelles d'huître plate (Ostrea edulis) a été étudiée à partir de l'analyse du polymorphisme de conformation simple brin (SSCP), d'un fragment d'environ 300 pb du gène de l'ARNr mitochondrial 12S. les échantillons (13 localités, 507 individus) utilisés avaient fait l'objet d'une étude antérieure de structuration des populations avec 5 locus microsatellites. Il ont été analysés ici dans le but d'une comparaison des structurations observées sur marqueurs mitochondrial et nucléaire. La diversité moyenne intrapopulation du gène de l'ARNr 12S (Hn.b = 0,494) est presque la moitié de celle estimée avec les microsatellites (Hn.b = 0,904) bien que la variance entre populations soit beaucoup plus forte pour l'ADN... |
Tipo: Text |
Palavras-chave: Génétique population; Huître plate; Ostrea edulis; Microsatellite; ARNr mitochondrial 12S; Diversité génétique. |
Ano: 1999 |
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00033/14381/11671.pdf |
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Lapegue, Sylvie; Taris, Nicolas; Boudry, Pierre; Langlade, Aime; Bonhomme, Francois. |
Le milieu marin est un milieu difficile à appréhender car composé d'un ensemble d'organismes et d'écosystèmes caractérisés par des conditions de fonctionnement tout à fait originales et souvent difficiles d'accès. Ces spécificités peuvent être attribuées à la structure spatiale du milieu marin, qui à bien des égards, diffère du milieu terrestre. En effet si les notions de barrières géographiques sont une réalité concrète pour les organismes terrestres, elles restent rarement identifiées en milieu marin (PALUMBI 1994). Dans un tel environnement, les organismes présentent des cycles de vie souvent mal connus, notamment ceux qui associent phase benthique et phase planctonique. L'étude de la structure génétique des populations, dans un espace aussi ouvert aux... |
Tipo: Text |
Palavras-chave: Diversité génétique; Génétique; Recrutement; Génotypage; Variabilité génétique; Huître plate; Ostrea edulis. |
Ano: 2003 |
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00044/15478/12857.pdf |
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Moreau, Dimitri. |
Le genre Crassostrea regroupe de nombreuses espèces dont la répartition mondiale s'étend sur une grande partie des régions côtières des basses et moyennes latitudes. La classification des différentes espèces décrites à partir des critères morphologiques et de répartition géographique est aujourd'hui remise en cause dans de nombreux cas par les nouvelles études utilisent les techniques récentes de biologie moléculaire. C'est en particulier grâce à l'apport des séquences génomiques variables, qu'il a été possible de déterminer différentes espèces présentes sur les côtes africaines et américaines (Lapègue & al.). La présence de l'espèce C. gasar, d'abord décrite en Afrique, a ainsi été montré en Amérique. La répartition de cette espèce sur les deux... |
Tipo: Text |
Palavras-chave: Génétique population; Huître de mangrove; Crassostrea gasear; Diversité génétique. |
Ano: 2001 |
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00033/14407/11700.pdf |
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Taris, Nicolas. |
Cette étude aborde la diversité génétique d'une espèce de bivalve marin, Ostrea edulis et plus particulièrement les interactions existant entre génétique (flux de gènes) et démographie (dynamique de reproduction) à l'échelle de la population. Elle repose sur l'utilisation de marqueurs microsatellites pour tenter de comprendre les facteurs participant à la mise ne place d'une structuration génétique au sein de laquelle peuvent être observés des phénomènes de déficit en hétérozygotes et de ration positive entre hétérozygotie et valeur sélective. L'un des objectifs est en particulier de tester l'hypothèse de consanguinité à l'échelle locale. Pour cela, nous avons étudier la structure génétique de cohortes d'huîtres plates au cours d'une saison de reproduction... |
Tipo: Text |
Palavras-chave: Ostrea edulis; Génétique des Populations; Microsatellites; Diversité génétique; Dynamique de recrutement. |
Ano: 2002 |
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00033/14419/11714.pdf |
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Taris, Nicolas; Sauvage, Christopher; Batista, Frederico; Baron, Sophie; Ernande, Bruno; Haffray, Pierrick; Boudry, Pierre. |
Previous studies have shown heritable variation in larval developmental traits in the Pacific oyster Crassostrea gigas. In order to study the genetic consequences of production of oyster larvae in hatcheries, two factors, specific to hatcheries, were examined: the effect of discarding the smallest larvae (i.e. culling) and the effect of temperature (20°C versus 26°C). A mixed-family approach was used in order to infer the genetic composition of larval populations and family assignment, limiting possible environmental bias and allowing the study of a relatively large number of families using a limited number of larval tanks. Our results show that three multiplexed highly polymorphic microsatellite markers are a powerful tool for family assignment and,... |
Tipo: Text |
Palavras-chave: Hatchery; Genetic diversity; Selection domestication; Larvae; Crassostrea gigas; Ecloserie; Diversité génétique; Sélection domestication; Larve; Crassostrea gigas. |
Ano: 2006 |
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/2006/acte-1505.pdf |
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Registros recuperados: 14 | |
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